La Sezione si occupa del settore dell'insegnamento superiore (alunni dai 15 ai 19 anni d'età); sono qui comprese le 5 sedi dei licei cantonali (Bellinzona, Lugano 1, Lugano 2, Locarno, Mendrisio) e la Scuola cantonale di commercio.

La Sezione provvede all'elaborazione dei programmi didattici e promuove iniziative di aggiornamento dei docenti. Il programma dei licei, ora in fase di revisione in seguito alla riforma degli studi liceali avviata nel settembre 1997, prevede un unico tipo di liceo con un modello a opzioni.