La Direzione dell'Aeroporto si occupa, assieme alla Sezione della logistica e degli stabili erariali e alla Sezione delle finanze del DFE, della gestione tecnica e finanziaria dell'Aeroporto cantonale secondo le prescrizioni federali e le indicazioni della Direzione del Dipartimento del territorio.

In particolare è demandata parte della competenza cantonale in materia di gestione dei voli con elicotteri.