La Segreteria generale (SG) del Dipartimento delle istituzioni funge da Stato maggiore e si occupa di sostenere tutte le unità amministrative del Dipartimento nell'ambito delle risorse umane, delle risorse finanziarie, dell'informatica, della logistica e del web.

In particolare, fornisce supporto e collaborazione al Direttore del Dipartimento nella progettazione, nell'organizzazione e nel coordinamento delle attività dipartimentali e in seno al Consiglio di Stato.

Inoltre, supervisiona i servizi con delega cantonale di competenza dipartimentale come il Servizio per l'integrazione degli stranieri.