L'Ufficio della gestione dei dati agricoli gestisce e assegna i pagamenti diretti, i contributi per singole colture, i contributi cantonali di declività e quelli per la conversione all'agricoltura biologica messi a disposizione dalla Confederazione e/o dal Cantone.

Con la politica agricola 2014-17, il sistema dei pagamenti diretti è impostato in funzione degli obiettivi fissati nella Costituzione federale (art. 104). Ad ogni obiettivo costituzionale si abbina uno dei seguenti provvedimenti:

• contributi per il paesaggio rurale volti a preservare l'apertura del paesaggio rurale;
• contributi per la sicurezza dell'approvvigionamento volti a mantenere un approvvigionamento sicuro della popolazione in derrate alimentari;
• contributi per la biodiversità volti a salvaguardare e a promuovere la diversità delle specie;
• contributi per la qualità del paesaggio volti a salvaguardare, promuovere e sviluppare paesaggi rurali variati;
• contributi per i sistemi di produzione volti a incentivare forme di produzione particolarmente in sintonia con la natura, rispettose dell'ambiente e degli animali (p.es. bio e produzione integrata);
• contributi per l'efficienza delle risorse volti a preservare le risorse;
• contributi di transizione volti a garantire uno sviluppo socialmente sostenibile.

L'Ufficio si occupa di varie altre tematiche, in particolare :

• il rilevamento dei dati agricoli e la loro trasmissione alle autorità federali, cantonali e ad altri enti;
• la gestione, sviluppo e/o consulenza per gli applicativi informatici (banche dati [Agricola, BDTA, Hoduflu, ecc.], portale agricolo, geoinformazione, ecc.) al fine di garantire un corretto versamento dei pagamenti diretti e integrare le tecnologie innovative nei processi;
• l’esame, la verifica sia amministrativa (test di plausibilità, ecc.) sia in loco (p.es. controlli della biodiversità) delle domande di contributo;
• l’evasione di reclami relativi ai pagamenti diretti;
• il coordinamento dei controlli delle aziende agricole al beneficio dei pagamenti diretti, in particolare, con altre autorità cantonali, quelle comunali e non da ultimo con gli organi di controllo privati;
• la supervisione degli  organi di controllo;
• l’accompagnamento, l’autorizzazione e/o l’implementazione di progetti, in particolare quelli d’interconnessione e per la qualità del paesaggio;
• l’armonizzazione dell’esecuzione sia a livello cantonale sia intercantonale;
• il miglioramento della collaborazione con le autorità cantonali, comunali, associazioni di categoria;
• la gestione delle richieste di tollerare la gestione di terreni incolti;
• l’informazione degli agricoltori, delle autorità e della popolazione sulle novità e sui vari progetti.