La Sezione è articolata in cinque servizi con distinte aree di competenza: il Servizio amministrativo, il Servizio degli affari militari e del comando di circondario, il Servizio della protezione civile, il Servizio costruzioni di protezione civile e il Servizio della protezione della popolazione.

Il servizio amministrativo centralizzato della sezione si occupa di fornire le prime informazioni all’utenza e di smistarle ai vari servizi di competenza. Altri compiti specifici sono la contabilità, la corrispondenza e il supporto logistico per tutta la sezione.

Il Servizio degli affari militari e comando di circondario si occupa delle pratiche amministrative legate ai servizi d’istruzione dei militi domiciliati in Ticino come pure degli obblighi fuori servizio (tiro obbligatorio, obbligo di notifica), tiene il controllo dei dati di servizio e di quelli personali dei militi con la collaborazione degli uffici di controllo abitanti dei comuni.

Il Servizio della protezione civile, unitamente al Centro istruzione della protezione civile di Rivera, assicura l'applicazione delle norme federali e cantonali di protezione civile nelle regioni e nei comuni, cura le diverse pianificazioni (allarmi, approvvigionamenti,...) e l'istruzione dei militi astretti.

Il Servizio costruzioni si occupa della pianificazione e gestione dei posti protetti, come pure della realizzazione delle costruzioni protette (rifugi, impianti regionali).

Il servizio della protezione della popolazione si occupa prevalentemente dei preparativi per i casi di emergenza e di catastrofe.