Il Museo Cantonale di Storia Naturale (MCSN) è responsabile della gestione della ricerca scientifica sul Monte San Giorgio:

• dal 2001 sulla base della Legge cantonale sulla protezione della natura del 12 dicembre 2001, e del relativo Regolamento di applicazione;
• dal 2009 sulla base dello specifico accordo programmatico tra Confederazione Svizzera (rappresentata dall’Ufficio federale dell’ambiente UFAM) e Cantone Ticino, relativo alla gestione del sito iscritto nella Lista del Patrimonio Mondiale.

La gestione scientifica è esercitata con il supporto di una piattaforma scientifica composta da istituti accademici e da esperti settoriali che spaziano dalla paleontologia dei vertebrati sino alle piante, ai pollini per arrivare ai film batterici.