Le numerose informazioni che un registro tumori può raccogliere devono essere codificate per poter essere archiviate e poi riutilizzate per analisi statistiche e per confronti con altri registri tumori. Tra queste informazioni, la localizzazione del tumore e la morfologia hanno un'importanza fondamentale e vengono sempre meglio puntualizzate tramite esami istologici e citologici.

Dal 01.01.2020, la classificazione dei tumori avviene mediante la International Classification of Diseases for Oncology, terza revisione (ICD-O-3.2) emanata dalla Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS-WHO). Tale codifica è ufficiale per i registri tumori.

Per ottenere la massima comparabilità dei dati, sia all'interno del Registro dei tumori sia all'esterno, vengono elaborate linee-guida e raccomandazioni per il loro rilevamento e per la loro codifica. Parte di queste raccomandazioni sono consultabili sul sito dell'European Network of Cancer Registries (ENCR).