Fondato nel 1480 dal frate francescano Bartolomeo da Ivrea e sviluppatosi nel corso dei secoli successivi, il complesso comprendente il Santuario dell'Assunta, l'annesso convento, le cappelle del Sacro Monte, la Via Crucis e la chiesa dell'Annunziata, è di proprietà dello Stato del Cantone Ticino dal 1848, e custodito dallo stesso anno dai frati Cappuccini.

Il complesso è stato oggetto di un'importante campagna di restauro iniziata nel 2009 che ha visto, oltre al restauro delle strutture e degli apparati decorativi, il consolidamento della roccia e la sistemazione delle vie d'accesso.

L'intervento conservativo, svolto in più tappe, si è concluso nel 2016 con la riapertura al pubblico del Museo Casa del Padre, che riunisce svariate testimonianze della religiosità legata al Santuario e alla vita del convento.